Estrutura Secundária das Proteínas

A estrutura secundária das proteínas se dá sempre pelas pontes de hidrogênio entre o oxigênio da carboxila envolvida em uma ligação peptídica com o nitrogênio de outra ligação peptídica.

A diferença entre se formar alfa-hélices ou folhas-beta (as duas estruturas secundárias mais comuns) é a maneira em que essas pontes de hidrogênio acontecem:

Nas alfa-hélice, como o próprio nome diz, os aminoácidos vão se enrolando à maneira de uma serpentina (à esquerda, na última figura) de forma que as pontes de hidrogênio unam as ligações peptídicas a cada quatro delas em sequência.

Nas folhas-beta, a união pelas pontes de hidrogênio se faz entre ligações peptídicas próximas, vizinhas (gerando estruturas planares, representadas como setas - na última figura) em sentido paralelo (ligações peptídicas unidas na mesma direção) ou anti-paralelo (ligações peptídicas em sentido contrário). No caso do sentido paralelo as folhas se "entortam" mais, pela desalinhamento dos átomos envolvidos.

Na linguagem da costura, a estrutura primária é o alinhavo, e a estrutura secundária a costura definitiva da proteína (dando o formato sustentado por "fios de pontes de hidrogênio").